La variante SARS-CoV-2 Omicron è caratterizzata, tra l’altro, da più di 30 cambiamenti di amminoacidi che si verificano sulla glicoproteina della punta rispetto alla proteina della punta SARS-CoV-2 originale.
Riportiamo un’analisi completa degli effetti dei cambiamenti dell’amminoacido spike di Omicron nell’interazione con gli anticorpi umani, ottenuti modellandoli in strutture 3D risolte disponibili pubblicamente selezionate di complessi spike-anticorpo e studiando gli effetti di queste mutazioni a livello strutturale.
Prevediamo che le interazioni del picco di Omicron con gli anticorpi umani possano essere influenzate negativamente o positivamente dai cambiamenti degli amminoacidi, con una perdita totale prevista di interazioni solo in pochi complessi. Inoltre, la nostra analisi applicata anche all’interazione spike-ACE2 prevede che questi cambiamenti di amminoacidi possano aumentare la trasmissibilità di Omicron.
Il nostro approccio può essere utilizzato per comprendere meglio la trasmissibilità, la rilevabilità e l’epidemiologia di SARS-CoV-2 e rappresenta un modello da adottare anche nel caso di altre varianti.
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